Un panel de 10 gene indică pacienţii cu cancer de colon care necesită chimioterapie după îndepărtarea chirurgicală a tumorii
Un nou studiu publicat în Cell Reports Medicine prezintă dezvoltarea şi validarea unui panel de 10 gene care poate indica pacienţii cu cancer de colon în stadiul II sau III la care chimioterapia adjuvantă prezintă beneficii. Au fost identificate modele de expresie simultană celor 10 gene care se asociază cu supravieţuirea prelungită în urma chimioterapiei administrate după îndepărtarea chirurgicală a neoplasmului.
Deşi numeroşi pacienţi cu cancer de colon în stadiul II sau III primesc chimioterapie adjuvantă după operația pentru îndepărtarea tumorii, acest protocol terapeutic nu îmbunătăţeşte supravieţuirea tuturor. Au fost depistaţi numeroşi biomarkeri pentru predicţia curbei de supravieţuire sau stabilirea prognosticului, dar aceştia nu contribuie în mod direct la stabilirea terapiei optime.
Deoarece tumorile pacienților cu cancer de colon prezintă profiluri genomice diferite, au fost analizate datele de expresie genetică din șase surse disponibile public pentru a construi un set de date de 933 de pacienți cu cancer de colon în stadiul II şi III.
A fost utilizată învățarea automată pentru a construi o rețea de mii de gene potențial relevante, care au fost restrânse mai întâi la o rețea de 18 gene și apoi la 10 gene. Întrucât rețeaua de 10 gene a trecut etapele de stabilire a relevanţei din punct de vedere biologic, a urmat construirea unui model care analizează tiparele de expresie ale acestor gene pentru a identifica pacienții care ar beneficia de pe urma chimioterapiei adjuvante.
Puterea de predicţie a panelului de gene utilizat a fost comparată cu cea a mii de reţele aleatorii cu 5-15 gene. Modelele de expresie a celor 10 gene au avut performanţe net superioare oricărei alte reţele genice evaluate pentru depistarea pacienţilor la care ar putea fi benefică administrarea chimioterapiei neoadjuvante.
De asemenea, pentru validare, au fost utilizate probe de ţesut tumoral de la 109 pacienţi cu cancer de colon în stadiul 2 și 3, analizate împreună cu informații despre răspunsul acestora la chimioterapia adjuvantă. Panelul de expresie genică a indicat cu acurateţe ridicată pacienţii care au beneficiat de pe urma administrării chimioterapiei adjuvante.
Noul model de expresie genică trebuie evaluat în studii clinice prospective pentru a demonstra dacă are într-adevăr un impact pozitiv asupra deciziilor clinice pentru pacienţii cu cancer de colon. Deoarece s-a constatat că panelul de gene ar putea indica, de asemenea, pacienţii cu cancer de colon care pot beneficia prin administrarea imunoterapiei, evaluarea potenţialului impact clinic va continua şi în această direcţie.
Citeşte şi:
- Testarea pentru mutațiile genei KRAS şi MSI se asociază cu dublarea supraviețuirii pacienților cu cancer colorectal
- MRD-EDGE, testul de biopsie lichidă care depistează recurența cancerului colorectal mai devreme decât metodele standard
- Guardant Reveal, primul test de biopsie lichidă care detectează riscul de recidivă a cancerului colorectal fără a cunoaște mutațiile specifice prezente la nivel tumoral